El análisis AMMI y la gráfica del Biplot en SAS





En este documento se presentan tres ejemplos de casos en los que se emplearon programas creados en SAS para obtener Modelos AMMI, así como la prueba de Gollob (Gollob, 1967) para determinar la significancia de cada termino AMMI. Con estos programas, se obtiene también de manera automática el biplot derivado de los modelos AMMI.

Las diferentes modalidades que aquí se presentan son:

1)  Cuando se cuenta únicamente con las medias ajustadas. En este caso, las medias ajustadas son suficientes para obtener los modelos AMMI y para graficar el biplot. Sin embargo, para la prueba de Gollob se necesita tener un estimador del error del análisis combinado, los grados de libertad del error y el número de repeticiones, los cuales se deben proporcionar al programa.

2)  Cuando se cuenta con toda la información, por ejemplo los valores de la variable de interés medida en cada uno de los ambientes, los genotipos y las repeticiones, pero se utiliza un análisis combinado que se considera que proviene de experimentos individuales en los que se utilizó un diseño de bloques completos. Se asume que los modelos son de efectos fijos y se analizan utilizando PROC GLM.
En este caso, se obtiene de forma automática el estimador del error, los grados de libertad del error y el número de repeticiones.  


3)  Similar al caso anterior, pero ahora se consideran experimentos individuales en los que se utilizó un diseño de látices (bloques incompletos), y se asume que los modelos son de efectos fijos y aleatorios simultáneamente (modelos mixtos). Se utiliza PROC MIXED para la obtención de las medias ajustadas y un estimador del error ponderado de cada uno de los análisis que se hicieron por separado. Asimismo, se emplean grados de libertad y numero de repeticiones también ponderados.



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